Organul suprem de elaborare şi adoptare a deciziilor în Universitate este Senatul. Acest organism se constituie din reprezentanюii aleşi ai consiliilor facultăţilor, rector, vice-rector, prorectori, reprezentanţi ai studenţilor, preşedinţii comitetelor sindicale al profesorilor şi al studenţilor.

Normele de reprezentare în Senat sînt stabilite în funcţie de numărul de posturi ocupate cu cadre didactice titulare. Studenţii sînt reprezentaţi în Senat în proporţie de 16% din numărul total de membri. Senatul se întruneşte lunar, оn şedinţe ordinare. Senatul deleagă prerogativele gestionării activităţilor curente în Universitate Biroului Senatului, Consiliului de administrare şi Activului administrativ. Biroul Senatului este format din: rector, vice-rector, prorectorşi, secretarul ştiinţific al Senatului.

Biroul Senatului se întruneşte săptămînal (sau la nevoie), sub preşedinţia rectorului şi asigură conducerea operativă a Universităţii. Consiliul de administrare este format din: rector, vice-rector, prorectori, decanii facultăţilor, contabilul-şef, secretar ştiinţific al Senatului. Activul administrativ este alcătuit din: rector, vice-rector, prorectori, decanii facultăţilor, secretar ştiinţific al Senatului, şeful secţiei organizarea procesului de instruire, şefii catedrelor universitare, şeful bibliotecii ştiinţifice, şeful serviciului personal, preşedinţii comitetelor sindicale al profesorilor şi al studenţilor. Consiliul de administraţie şi Activul administrativ sînt coordonate de către rector şi îşi desfăşoară activitatea în baza Statului universităţii.

Domeniile principale de competenţă constau în: organizarea şi controlul activităţii în plan administrativ şi de secretariat; propunerea de măsuri pentru optimizarea activităţii administrative şi financiar-contabile; elaborarea bugetului anual al Universităţii; identificarea altor surse de finanţare, în afara celor alocate de la buget; stabilirea criteriilor de repartizare a resurselor economice şi financiare pe facultăţi, catedre, servicii, alte structuri organizatorice ale universităţii.